На главную страницу второго семестра

Банки данных Swiss-Prot и UniProt

Данные банка Swiss-Prot о белке SODC_ECOLI (Cu, Zn - зависимая супероксиддисмутаза)

Описание Метка поля Запись
Стандартное имя последовательности (идентификатор последовательности) ID SODC_ECOLI
Внутренний уникальный постоянный идентификатор документа AC P53635; P96756;
Название белка, отражающее его функции DE Cu, Zn - зависимая супероксиддисмутаза (EC 1.15.1.1)
Дата создания документа DT 01-OCT-1996 (Rel. 34, Created)
Дата последнего исправления аннотации DT 25-JAN-2005 (Rel. 46, Last annotation update)
Название организма OS Escherichia coli O157:H7 and Escherichia coli
Полное название таксона OC Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Escherichia
Длина последовательности SQ 173 a.o.
Молекулярная масса белка SQ 17681 а.е.м.
Число публикаций, использованных при создании документа RN 9
Название журнала с самой свежей публикацией RL Nature 409:529-533(2001)
Описание вторичной структуры FT Описание состоит в указании концевых атомов элементов вторичной структуры.
Содержание поля комментариев CC Функции, каталитическая активность, кофакторы, биофизикохимические свойства, количество субъединиц, расположение, принадлежность.
Особенности последовательности FT Указаны координаты начального и конечного остатка сигнального участка белка, начала и конца цепи белка, координаты дисульфидной связи, координаты лигандов.
Идентификатор файла PDB DR 1ESO

Эту и другую информацию можно получить здесь

Результаты поиска в БД UniProt белков с тем же кратким описанием (DE), что и у белка SODC_ECOLI K-12

Поиск проводился с помощью внутренней поисковой машины базы данных SRS (Sequence Retrieval System).
Таксон Запрос Количество найденных документов
Археи (Archaea) ((((([uniprot-Description:Superoxide*] & [uniprot-Description:dismutase*]) & [uniprot-Description:1.15.1.1*]) & [uniprot-Description:cu-zn*]) & [uniprot-Description:precursor*]) & [uniprot-Taxonomy:Archaea*]) 0
Бактерии (Bacteria) ((((([uniprot-Description:Superoxide*] & [uniprot-Description:dismutase*]) & [uniprot-Description:1.15.1.1*]) & [uniprot-Description:cu-zn*]) & [uniprot-Description:precursor*]) & [uniprot-Taxonomy:Bacteria*]) 23
Эукариоты (Eukaryota) ((((([uniprot-Description:Superoxide*] & [uniprot-Description:dismutase*]) & [uniprot-Description:1.15.1.1*]) & [uniprot-Description:cu-zn*]) & [uniprot-Description:precursor*]) & [uniprot-Taxonomy:Eukaryota*]) 21


© Галкин Иван, 2005